Después de años en fuerzas básicas de los Tiburones Rojos de su natal Veracruz, Sebastián debutó en Copa en 2017 y en Liga MX en 2017, y en poco tiempo se hizo con la titularidad del primer equipo. Tras quedar como agente libre a finales de 2019, firmó con Cruz Azul.

Ha participado con la Selección Mexicana Sub-22, ganando el preolímpico de CONCACAF, así como en los Juegos Olímpicos de Tokio como suplente, consiguiendo el tercer lugar y con ello la medalla de bronce, ambos en 2021.

Es una de las grandes promesas de la portería en México, demostrándolo con atajadas impresionantes y grandes reflejos.